A pequena Zlata tem onze anos e vive em Sarajevo. Como a grande maioria das garotas da sua idade, ela mantém um diário, no qual vai registrando tudo o que acontece em seu cotidiano.
Ao contrário das outras meninas, principalmente as que vivem no mundo ocidental, que escrevem sobre paqueras, ídolos e moda, Zlata tem que deixar de lado os tópicos juvenis. A garota despeja passa a relatar todo o medo, a raiva e a perplexidade diante da guerra que eclodiu na ex-Iugoslávia.
"O Diário de Zlata" retrata a violência e o temor de uma geração por um ponto de vista ainda ingênuo, de uma menina que mal começou a viver.